Dans le livre de l'Ayatollah Pasandideh concernant l'histoire de sa famille, on peut lire : "Notre arrière-grand-père 'Seyyed Bozorg' (Seyyd le grand), surnommé 'Din Shah', était un Seyyed (descendant du Prophète) originaire de l'Inde et vivait au Cachemire. Le mot 'Shah' après son nom signifie Seyyed." (Mémoires de l'Ayatollah Pasandideh, Publications de l'Institut pour la compilation et la publication des œuvres de l'Imam Khomeiny, p.41)
Il poursuit : "Notre grand-père, le défunt Seyyed Ahmad, connu sous le nom de Seyyed Ahmad Hindi, était, selon les documents existants, le fils de Din Ali Shah... Entre les années 1240 et 1250 du calendrier hégirique, il quitta sa terre natale en Inde et au Cachemire pour se rendre aux lieux saints, soit pour un pèlerinage, soit pour s'exiler. Il est possible qu'il ait choisi de quitter sa patrie pour échapper à l'insupportable pouvoir britannique..." (ibid., p.42)
Cependant, selon l'arbre généalogique établi par Heshmatollah Riazi Yazdi, inclus à la fin de ces mêmes mémoires, le treizième ancêtre de l'Imam Khomeiny, nommé Seyyed Heydar Mousavi Safavi Ardabili Kordi, qui était Seyyed Hosseini tant du côté paternel que maternel, fut envoyé en 766 de l'hégire au Cachemire par le grand mystique Mir Seyyed Ali Hamadani pour diffuser le message spirituel et mystique. Les ancêtres de l'Imam se consacrèrent alors avec ferveur à la propagation de la religion dans cette région, certains allant jusqu'au martyre. Plus tard, Seyyed Ahmad, le grand-père de l'Imam, partit pour les lieux saints à Nadjaf, puis s'installa en Iran, à Khomein, où se poursuivit l'histoire de la famille.